مطالعه طیف­سنجی و دینامیک مولکولی برهمکنش کمپلکس­های پالادیوم (ii) از لیگاندهای فنانترولین و مشتقات گلایسین با dna غده تیموس گوساله (dna-ct)

مطالعه برهمکنش بین کمپلکس­های پالادیوم (ii) و dna برای کشف دارو بسیار مهم می­باشد. در این مطالعه به دلیل پیوند قوی بین پالادیوم با dna، سه ساختار کمپلکس­های پالادیوم (ii) با فرمول [pd(phen)(r-gly)]no3 انتخاب شدند که phen (فنانترولین) و r-gly (متیل، پروپیل و آمیل-گلایسین) می­باشد. برهمکنش سه کمپلکس پالادیوم (ii) با ct-dna به وسیله­ی روش­های جذب uv، نشر فلوئورسانس، دورنگ­نمایی دورانی، ویسکوزیته، ولتامتری چرخه­ای و همچنین شبیه­سازی دینامیک مولکولی (md) و داکینگ مولکولی مورد بررسی قرار گرفت. این کمپلکس­ها با dna در محلول بافر تریس حاوی کلرید سدیم 10 میلی­مولار (ph=7.4)، در دمای 27 و37 درجه سانتیگراد (سلسیوس) برهمکنش داشتند. نتایج تجربی نشان می­دهد که برهمکنش این کمپلکس­ها با dna از نوع اینترکلیشن بود. علاوه بر این، برهمکنش کمپلکس­های پالادیوم (ii) با dna در غلضت­ها و دماهای بالاتر بیشتر بود. در نهایت پارامترهای ساختاری به دست آمده از شبیه­سازی (md) نشان داد که این کمپلکس­ها پیوند هیدروژنی مولکولی را کاهش داده و با ct-dna اینترکلیت شدند. نتایج محاسبات توافق خوبی با مطالعات تجربی داشتند.